隨著人們對(duì)環(huán)境微生物認(rèn)識(shí)的不斷加深,在環(huán)境監(jiān)測(cè)、治理,工、農(nóng)業(yè)生產(chǎn)及健康評(píng)估、疾病診斷等領(lǐng)域,微生物的重要性正在不斷凸顯,對(duì)環(huán)境中微生物的種類與豐度進(jìn)行定性、定量檢測(cè)也成了科學(xué)研究與實(shí)踐應(yīng)用的基礎(chǔ),并直接關(guān)系著科研結(jié)果的可信度與生產(chǎn)應(yīng)用的可靠性。
高通量測(cè)序技術(shù)的快速發(fā)展使得目前對(duì)環(huán)境微生物的研究擺脫了對(duì)于微生物培養(yǎng)技術(shù)的依賴,但目前國內(nèi)并沒有相對(duì)應(yīng)的檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)出臺(tái),復(fù)雜的環(huán)境微生物群落,不規(guī)范的檢測(cè)方法,也造成了檢測(cè)數(shù)據(jù)的混亂及結(jié)論、結(jié)果的矛盾。為了確保高通量測(cè)序技術(shù)的有序應(yīng)用,深圳華大基因科技有限公司、深圳基因產(chǎn)學(xué)研資聯(lián)盟、中國測(cè)試技術(shù)研究院、深圳華大臨床檢驗(yàn)中心在國家標(biāo)準(zhǔn)化管理委員會(huì)的主管下,起草編制了《環(huán)境微生物宏基因組檢測(cè) 高通量測(cè)序法》。
經(jīng)過技術(shù)調(diào)研、咨詢、收集和消化有關(guān)資料,結(jié)合環(huán)境微生物宏基因組檢測(cè)方法及高通量測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用,編制組遵循統(tǒng)一性、協(xié)調(diào)性、適用性、一致性、規(guī)范性的原則,本著先進(jìn)性、科學(xué)性、合理性和可操作性的原則,依據(jù)GB/T 1.1-2009《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則 第1部分:標(biāo)準(zhǔn)的結(jié)構(gòu)和編寫》給出的規(guī)則并參照了GB/T 20001.4—2015《標(biāo)準(zhǔn)編寫規(guī)則 第4部分:實(shí)驗(yàn)方法標(biāo)準(zhǔn)》,在引用了GB/T 6682《分析試驗(yàn)室用水規(guī)格和實(shí)驗(yàn)方法》、GB 19489-2008《實(shí)驗(yàn)室生物安全通用要求》、GB/T 19495.5-2004《轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測(cè)核酸定量 PCR檢測(cè)方法》、GB/T 30989-2014《高通量基因測(cè)序技術(shù)規(guī)程》、GB/T 35537-2017《高通量基因測(cè)序結(jié)果評(píng)價(jià)要求》等文件后,規(guī)定了基于高通量測(cè)序進(jìn)行環(huán)境微生物宏基因組檢測(cè)的主要內(nèi)容,包括樣品采集、保存和運(yùn)輸,實(shí)驗(yàn)室樣品接收與處理,微生物DNA樣品的制備,提取后DNA樣品判斷質(zhì)量,后續(xù)文庫構(gòu)建與高通量測(cè)序,數(shù)據(jù)質(zhì)控要求,數(shù)據(jù)處理過程,結(jié)果與報(bào)告。
閱讀征求意見稿后可知,標(biāo)準(zhǔn)中所規(guī)定的檢測(cè)存在于環(huán)境樣本中微生物的方法原理是,先運(yùn)用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)環(huán)境樣品中微生物的總體遺傳物質(zhì)進(jìn)行測(cè)序,然后通過測(cè)序結(jié)果與現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫中序列的比對(duì)來檢測(cè)樣品中所含的微生物的種類和相對(duì)豐度。而該方法需要高通量測(cè)序儀、PCR儀、冷凍離心機(jī)、微量移液器、紫外分光光度計(jì)、電泳儀、凝膠成像系統(tǒng)、水浴鍋、低溫冰箱等設(shè)備。
相信本標(biāo)準(zhǔn)的建立和普及不僅能夠規(guī)范和統(tǒng)一高通量測(cè)序的環(huán)境微生物檢測(cè)技術(shù)流程,還能讓健康、環(huán)境、農(nóng)業(yè)等涉及微生物檢測(cè)的各個(gè)行業(yè)有更統(tǒng)一和順暢的評(píng)估、交流語境,從而能為全民健康及工農(nóng)業(yè)技術(shù)進(jìn)步提供有力的保障和支持并促進(jìn)科研及相關(guān)領(lǐng)域經(jīng)濟(jì)的發(fā)展。
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