串聯(lián)測序技術(shù)研發(fā)成功 基因組學(xué)將實現(xiàn)重大突破

   近日，中國海洋大學(xué)海洋生物遺傳學(xué)與育種教育部重點實驗室包振民教授團隊在國際權(quán)威雜志Nature子刊Nature Protocols上在線發(fā)表了最新研究成果：串聯(lián)測序等長RAD標簽應(yīng)用于高效、低成本全基因組范圍遺傳和表觀遺傳變異篩查分析。

   這是該團隊繼2012年在Nature Methods、2015年在Open Biology后，再次在國際高通量基因組分析技術(shù)領(lǐng)域發(fā)表高水平論文，這也是學(xué)校首次在此期刊上發(fā)表論文，凸顯了中國海洋大學(xué)在相關(guān)研究領(lǐng)域的國際地位及重要影響力。

　“海洋生物遺傳學(xué)與育種”教育部重點實驗室包振民教授和王師教授為該研究成果的共同通訊作者，該研究獲得國家自然科學(xué)基金、國家863計劃、山東省杰出青年基金、海洋國家實驗室“鰲山人才”等項目資助。

　包振民教授團隊長期致力于發(fā)展適用于非模式生物的高通量、低成本的基因組學(xué)新方法和新技術(shù)。全基因組SNP分型技術(shù)是解析全基因組范圍內(nèi)遺傳變異與性狀關(guān)系的核心技術(shù)手段，已成為生命科學(xué)領(lǐng)域大規(guī)模應(yīng)用基因組信息進行重要性狀遺傳解析的研發(fā)熱點。在該最新研究中，團隊在前期開發(fā)的2b-RAD簡化基因組分型技術(shù)和MethylRAD全基因組DNA甲基化檢測技術(shù)的基礎(chǔ)上，成功研發(fā)了串聯(lián)標簽測序技術(shù)。

  這項技術(shù)在一個測序片段（reads）實現(xiàn)了對多達5個標簽同時分析，解決了2b-RAD技術(shù)無法應(yīng)用于雙末端測序平臺的局限，使得簡并基因組分析成本大大降低（單標簽測序成本僅為技術(shù)改進前的十分之一）。同時，該技術(shù)也首次實現(xiàn)了全基因組SNP分型和DNA甲基化的同步聯(lián)合分析。研發(fā)的新技術(shù)為低成本、大規(guī)模開展非模式生物特別是海洋生物基因組學(xué)及分子育種學(xué)研究提供了關(guān)鍵技術(shù)手段，也可應(yīng)用于農(nóng)作物、畜牧和模式動物等，具有廣闊的應(yīng)用前景。