近日,中國海洋大學(xué)海洋生物遺傳學(xué)與育種教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室包振民教授團(tuán)隊(duì)在國際權(quán)威雜志Nature子刊Nature Protocols上在線發(fā)表了最新研究成果:串聯(lián)測序等長RAD標(biāo)簽應(yīng)用于高效、低成本全基因組范圍遺傳和表觀遺傳變異篩查分析。
這是該團(tuán)隊(duì)繼2012年在Nature Methods、2015年在Open Biology后,再次在國際高通量基因組分析技術(shù)領(lǐng)域發(fā)表高水平論文,這也是學(xué)校首次在此期刊上發(fā)表論文,凸顯了中國海洋大學(xué)在相關(guān)研究領(lǐng)域的國際地位及重要影響力。
“海洋生物遺傳學(xué)與育種”教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室包振民教授和王師教授為該研究成果的共同通訊作者,該研究獲得國家自然科學(xué)基金、國家863計(jì)劃、山東省杰出青年基金、海洋國家實(shí)驗(yàn)室“鰲山人才”等項(xiàng)目資助。
包振民教授團(tuán)隊(duì)長期致力于發(fā)展適用于非模式生物的高通量、低成本的基因組學(xué)新方法和新技術(shù)。全基因組SNP分型技術(shù)是解析全基因組范圍內(nèi)遺傳變異與性狀關(guān)系的核心技術(shù)手段,已成為生命科學(xué)領(lǐng)域大規(guī)模應(yīng)用基因組信息進(jìn)行重要性狀遺傳解析的研發(fā)熱點(diǎn)。在該最新研究中,團(tuán)隊(duì)在前期開發(fā)的2b-RAD簡化基因組分型技術(shù)和MethylRAD全基因組DNA甲基化檢測技術(shù)的基礎(chǔ)上,成功研發(fā)了串聯(lián)標(biāo)簽測序技術(shù)。
這項(xiàng)技術(shù)在一個(gè)測序片段(reads)實(shí)現(xiàn)了對(duì)多達(dá)5個(gè)標(biāo)簽同時(shí)分析,解決了2b-RAD技術(shù)無法應(yīng)用于雙末端測序平臺(tái)的局限,使得簡并基因組分析成本大大降低(單標(biāo)簽測序成本僅為技術(shù)改進(jìn)前的十分之一)。同時(shí),該技術(shù)也首次實(shí)現(xiàn)了全基因組SNP分型和DNA甲基化的同步聯(lián)合分析。研發(fā)的新技術(shù)為低成本、大規(guī)模開展非模式生物特別是海洋生物基因組學(xué)及分子育種學(xué)研究提供了關(guān)鍵技術(shù)手段,也可應(yīng)用于農(nóng)作物、畜牧和模式動(dòng)物等,具有廣闊的應(yīng)用前景。
標(biāo)簽:串聯(lián)測序
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