單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組和甲基化組測(cè)序新技術(shù)被發(fā)現(xiàn)

　　單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組和甲基化組分析已經(jīng)成為了單細(xì)胞研究的強(qiáng)大工具。然而，在單細(xì)胞中揭示DNA甲基化與基因表達(dá)的直接關(guān)聯(lián)還比較困難。這是因?yàn)榧?xì)胞之間存在較大的差異，又不能同時(shí)檢測(cè)一個(gè)細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組和甲基化組。
　　
　　加州大學(xué)范國(guó)平教授和同濟(jì)大學(xué)薛志剛教授領(lǐng)導(dǎo)團(tuán)隊(duì)解決了這個(gè)問(wèn)題。他們?cè)谖逶挛迦盏腉enomeBiology雜志上發(fā)布了自己開發(fā)的新測(cè)序方法——scMT-seq。這種方法能夠同時(shí)分析單個(gè)細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組和甲基化組。
　　
　　研究人員用這種方法對(duì)感覺(jué)神經(jīng)元進(jìn)行研究，揭示了細(xì)胞間的轉(zhuǎn)錄組和甲基化組異質(zhì)性。不過(guò)，這些差異大多不是啟動(dòng)子甲基化造成的。舉例來(lái)說(shuō)，啟動(dòng)子帶CpG島的基因，表達(dá)水平與基因體甲基化正相關(guān)。這項(xiàng)研究表明，scMT-seq可以用來(lái)檢測(cè)單細(xì)胞中的轉(zhuǎn)錄組、甲基化組和單核苷酸多態(tài)性信息，進(jìn)而解析表觀遺傳學(xué)基因調(diào)控機(jī)制。
　　
　　2013年，范國(guó)平教授、薛志剛教授和南京醫(yī)科大學(xué)的劉嘉茵教授用單細(xì)胞RNA測(cè)序技術(shù)揭示了人類和小鼠早期胚胎的遺傳程序，并將自己的研究成果發(fā)表在Nature雜志上。該項(xiàng)研究成果將在干細(xì)胞的純化、分類及臨床治療領(lǐng)域產(chǎn)生深遠(yuǎn)的影響，也將為改善人類輔助生殖技術(shù)和提高人口出生質(zhì)量提供幫助。
　　
　　單細(xì)胞基因組學(xué)領(lǐng)域近年來(lái)發(fā)展得非常迅速，為人們揭示了復(fù)雜生物學(xué)體系的許多重要線索，包括微生物群落的生態(tài)多樣性和人類癌癥的基因組。今年一月NatureReviewsGenetics雜志發(fā)表的一篇重要綜述，全面介紹了單細(xì)胞基因組測(cè)序的發(fā)展現(xiàn)狀。文章的通訊作者是著名科學(xué)家、斯坦福大學(xué)生物工程系主任StephenR.Quake。
　　
　　前不久，克薩斯大學(xué)MD安德森癌癥中心的研究人員開發(fā)了首個(gè)用于單細(xì)胞DNA測(cè)序的突變檢出程序，Monovar。這一重要成果發(fā)表在四月十八日的NatureMethods雜志上，文章通訊作者是MD安德森癌癥中心的助理教授KenChen博士和NicholasNavin。Chen博士本科畢業(yè)于清華大學(xué)，隨后在Illinois大學(xué)取得博士學(xué)位。
　　
　　作者簡(jiǎn)介：
　　
　　范國(guó)平教授,1995獲美國(guó)凱斯西儲(chǔ)大學(xué)神經(jīng)科學(xué)的博士學(xué)位，1994-2011年初在麻省理工學(xué)院WhiteheadInstitute做博士后；2001至今任美國(guó)加州大學(xué)洛杉磯分校醫(yī)學(xué)院人類遺傳學(xué)系的終身制助理教授、副教授、正教授。在2009年起任同濟(jì)大學(xué)講座教授。他2007年起任美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院研究基金特約評(píng)審員，美國(guó)馬里蘭州及康奈迪克州干細(xì)胞研究基金評(píng)審員，中國(guó)國(guó)家自然科學(xué)基金委員會(huì)及教育部長(zhǎng)江學(xué)者海外特約評(píng)審員，及Science,CellStemCell,PNAS、Neuron,NatureNeuroscience,HumanMolecularGenetics,StemCells等多約20本國(guó)際雜志的審稿人.
　　
　　薛志剛同濟(jì)大學(xué)再生醫(yī)學(xué)系干細(xì)胞研究中心，同濟(jì)醫(yī)院干細(xì)胞臨床轉(zhuǎn)化中心，教授、博士生導(dǎo)師。2013年，采用單細(xì)胞RNA測(cè)序技術(shù)揭示了人類和小鼠早期胚胎的遺傳程序，研究成果發(fā)表在《Nature》雜志上。五年內(nèi)發(fā)表論文20余篇，作為課題負(fù)責(zé)人獲得國(guó)家自然科學(xué)基金資助兩項(xiàng)，多次作為科研骨干參與國(guó)家基金委、科技部973、863、國(guó)際合作等科研項(xiàng)目，上海市“曙光計(jì)劃”項(xiàng)目資助。