SmidgIon納米孔設備可實現(xiàn)采用iPhone供電

    Oxford Nanopore正在開發(fā)一款名為SmidgIon的納米孔設備。這款設備采用與MinION和PromethIon設備相同的納米傳感技術，但它比 MinION更小，每個流動槽中有256個通道。它可以通過充電接口和耳機接口與智能手機或其他移動設備連接，運行4-5小時。Oxford Nanopore的用戶組會議于5月底在倫敦召開。媒體并沒有被邀請，不過一些用戶和博主已經在Twitter上透露了最新消息。Oxford Nanopore正在開發(fā)一款智能手機供電的納米孔測序儀以及一款低成本的文庫制備系統(tǒng)。　　據首席技術官Clive Brown介紹，Oxford Nanopore正在開發(fā)一款名為SmidgIon的納米孔設備。這款設備采用與MinION和PromethIon設備相同的納米傳感技術，但它比MinION更小，每個流動槽中有256個通道。它可以通過充電接口和耳機接口與智能手機或其他移動設備連接，運行4-5小時。　　

    SmidgIon設備適合各種現(xiàn)場分析，有望應用在疾病爆發(fā)時病原體的遠程監(jiān)控，環(huán)境樣品的現(xiàn)場分析，食品、木材或野生動物的實時鑒定，以及農業(yè)環(huán)境的實地分析等。此產品有望在2017年第四季度推出。　　

    Oxford Nanopore的Zumbador項目正在開發(fā)另一款簡單便攜的產品，希望將核酸提取和文庫制備融合在一個設備中。在示意圖中，這個設備直接插入流動槽。原始樣本在一端加入，從另一端出來，可立即用于測序?！　?br />

    據Brown介紹，第一臺PromethIon測序儀已于近期交付給了客戶。他展示了該平臺的一些內部數據，使用的是48個模塊化流動槽，每個含有3,000個通道。利用R9試劑，它的準確性和孔利用率與MinION一致。PromethIon能夠在每次48小時的運行內獲得高達6.2 Tb的數據，未來有望增加至12.4 Tb?！　?br />

    此外，帶有R7納米孔的流動槽將不再出售，而是被帶有R9納米孔的流動槽取代。新的流動槽采用更堅固的膜和新的解旋酶馬達蛋白。Brown表示，公司在新的流動槽上獲得的最長讀長達500 kb，目前正致力于提高通量和均聚物檢測?！　?br />

    公司表示，R9帶來更高的準確性，特別是對于1D序列，即只讀取DNA的一條鏈。R9流動槽以每秒250個堿基的速度測序，比之前R7的每秒70個堿基有很大提升，因此將大大提高MinION的產量。據Brown介紹，目前1D序列的準確性接近90%，而2D序列則在95%左右。　

    隨著R9流動槽的上市，Oxford Nanopore還將推出快速測序試劑盒。它的文庫制備只需要10分鐘，而且需要的耗材比以往更少，在MinION運行開始后立即分析數據。目前，這個試劑盒正被一些早期試用客戶測試，將盡快推出。