新型納米孔測(cè)序儀將問(wèn)世 適合各種檢測(cè)現(xiàn)場(chǎng)分析

　　導(dǎo)讀：Oxford Nanopore正在開(kāi)發(fā)一款智能手機(jī)供電的納米孔測(cè)序儀以及一款低成本的文庫(kù)制備系統(tǒng)。這款設(shè)備采用與MinION和PromethIon設(shè)備相同的納米傳感技術(shù)，但它比MinION更小，每個(gè)流動(dòng)槽中有256個(gè)通道，適合各種現(xiàn)場(chǎng)分析。據(jù)介紹，第一臺(tái)PromethIon測(cè)序儀已于近期交付給了客戶。
 
　　Oxford Nanopore的用戶組會(huì)議于5月底在倫敦召開(kāi)。媒體并沒(méi)有被邀請(qǐng)，不過(guò)一些用戶和博主已經(jīng)在Twitter上透露了最新消息。Oxford Nanopore正在開(kāi)發(fā)一款智能手機(jī)供電的納米孔測(cè)序儀以及一款低成本的文庫(kù)制備系統(tǒng)。
　　
　　測(cè)序儀
　　
　　據(jù)首席技術(shù)官Clive Brown介紹，Oxford Nanopore正在開(kāi)發(fā)一款名為SmidgIon的納米孔設(shè)備。這款設(shè)備采用與MinION和PromethIon設(shè)備相同的納米傳感技術(shù)，但它比MinION更小，每個(gè)流動(dòng)槽中有256個(gè)通道。它可以通過(guò)充電接口和耳機(jī)接口與智能手機(jī)或其他移動(dòng)設(shè)備連接，運(yùn)行4-5小時(shí)。
　　
　　SmidgIon設(shè)備適合各種現(xiàn)場(chǎng)分析，有望應(yīng)用在疾病爆發(fā)時(shí)病原體的遠(yuǎn)程監(jiān)控，環(huán)境樣品的現(xiàn)場(chǎng)分析，食品、木材或野生動(dòng)物的實(shí)時(shí)鑒定，以及農(nóng)業(yè)環(huán)境的實(shí)地分析等。此產(chǎn)品有望在2017年第四季度推出。
　　
　　Oxford Nanopore的Zumbador項(xiàng)目正在開(kāi)發(fā)另一款簡(jiǎn)單便攜的產(chǎn)品，希望將核酸提取和文庫(kù)制備融合在一個(gè)設(shè)備中。在示意圖中，這個(gè)設(shè)備直接插入流動(dòng)槽。原始樣本在一端加入，從另一端出來(lái)，可立即用于測(cè)序。
　　
　　據(jù)Brown介紹，第一臺(tái)PromethIon測(cè)序儀已于近期交付給了客戶。他展示了該平臺(tái)的一些內(nèi)部數(shù)據(jù)，使用的是48個(gè)模塊化流動(dòng)槽，每個(gè)含有3,000個(gè)通道。利用R9試劑，它的準(zhǔn)確性和孔利用率與MinION一致。PromethIon能夠在每次48小時(shí)的運(yùn)行內(nèi)獲得高達(dá)6.2Tb的數(shù)據(jù)，未來(lái)有望增加至12.4Tb。
　　
　　此外，帶有R7納米孔的流動(dòng)槽將不再出售，而是被帶有R9納米孔的流動(dòng)槽取代。新的流動(dòng)槽采用更堅(jiān)固的膜和新的解旋酶馬達(dá)蛋白。Brown表示，公司在新的流動(dòng)槽上獲得的最長(zhǎng)讀長(zhǎng)達(dá)500kb，目前正致力于提高通量和均聚物檢測(cè)。
　　
　　公司表示，R9帶來(lái)更高的準(zhǔn)確性，特別是對(duì)于1D序列，即只讀取DNA的一條鏈。R9流動(dòng)槽以每秒250個(gè)堿基的速度測(cè)序，比之前R7的每秒70個(gè)堿基有很大提升，因此將大大提高M(jìn)inION的產(chǎn)量。據(jù)Brown介紹，目前1D序列的準(zhǔn)確性接近90%，而2D序列則在95%左右。
　　
　　隨著R9流動(dòng)槽的上市，Oxford Nanopore還將推出快速測(cè)序試劑盒。它的文庫(kù)制備只需要10分鐘，而且需要的耗材比以往更少，在MinION運(yùn)行開(kāi)始后立即分析數(shù)據(jù)。目前，這個(gè)試劑盒正被一些早期試用客戶測(cè)試，將盡快推出。
　　
文章鏈接：中國(guó)化工儀器網(wǎng) http://www.chem17.com/news/detail/93477.html