ctDNA精準測序難點新突破

　　在3月6日-11日舉行的舊金山分子醫(yī)學三方會議（TheMolecularMedicineTri-Conference）上，安可濟（AccuraGen）公司的聯(lián)合創(chuàng)始人兼科研總監(jiān)趙奇志（GraceZhao）博士首次發(fā)表了安可濟獨創(chuàng)的ctDNA高通量測序技術FireflyTM的原理，及其和國際主流技術的性能比較，證明基于FireflyTM技術開發(fā)的基因液態(tài)活檢產(chǎn)品可能是目前國際上性能最好的ctDNA高通量測序產(chǎn)品。這意味著由中國海外學者創(chuàng)始的這家國際公司在腫瘤液態(tài)活檢領域走在了世界前列。
　　
　　日前，國際知名基因組專業(yè)網(wǎng)站GenomeWeb對此做了報道。舊金山分子醫(yī)學三方會議已有23年歷史，聚焦分子醫(yī)學，涵蓋新藥研發(fā)、基因組學、體外診斷、生物信息、商務策略、平臺開發(fā)等多領域，是診斷方法與新藥研發(fā)領域相關人士不可錯過的一流國際盛會。
　　
　　液態(tài)活檢是腫瘤精準醫(yī)療領域炙手可熱的明星技術。循環(huán)腫瘤DNA（ctDNA）高通量測序技術是液態(tài)活檢的一種，也是最具前景的。它只需像化驗肝腎功能那樣采集靜脈血，即可對全身的腫瘤基因信息進行精確測定，基于腫瘤基因信息，就可以指導抗腫瘤藥物選用、療效評估、預后判斷，甚至早期發(fā)現(xiàn)和早期診斷。然而，精確測序ctDNA存在兩個巨大技術障礙：首先是血漿中的ctDNA含量極低，做不了幾個檢測反應。其次是二代測序背景噪聲很高，用常規(guī)建庫測序方法腫瘤信號完全淹沒在背景噪聲中。全球這一領域的頂尖高手都在致力于攻克這兩個難題。
　　
　　在3月11日的循環(huán)腫瘤DNA分會場上，趙奇志博士主持了會議，并報告了FireflyTM技術的原理與進展。安可濟采用單鏈環(huán)化DNA滾環(huán)復制串聯(lián)重復確認法，取代國際主流的雙鏈DNA分子條碼擴增比對確認法，在解決了微量的循環(huán)腫瘤DNA擴增難題的同時極大地提高了檢測靈敏度和特異性?；谠摷夹g開發(fā)的涵蓋61個基因測序的安可行TM產(chǎn)品已經(jīng)完成了性能驗證，正在中國推進針對不同癌癥種類的6個臨床合作研究項目。臨床研究結果證明了在晚期肺癌病例中，ctDNA與組織測序98%病例符合率和高達87%位點符合率。通過對胰腺癌的近兩年的研究觀察，發(fā)現(xiàn)了ctDNA突變譜與預后和化療獲益率之間的相關性。在直結腸癌指導用藥研究中，發(fā)現(xiàn)了明確的ctDNA與療效和復發(fā)的相關性。這些研究成果已經(jīng)投稿今年六月的美國臨床腫瘤學會（ASCO）年會，也為下一步產(chǎn)品開發(fā)奠定了堅實的基礎。若干年前，蘋果創(chuàng)始人喬布斯花10萬美金進行腫瘤基因測序，還只能取材腫瘤組織活檢標本，這在實際應用中有很大局限。而只需采血的液態(tài)活檢則應用極為方便。不僅如此，組織活檢像切蛋糕一樣，只檢測了腫瘤的一部分，而循環(huán)血中的ctDNA則能反映腫瘤全貌，這對全面了解腫瘤特征、精準給藥提供了前所未有的視野。
　　
　　目前，兩年多年前初創(chuàng)于美國加州PaloAlto的安可濟公司已經(jīng)遷至MenloPark，形成了國際一流的研發(fā)團隊，同時，在中國上海設立了首個醫(yī)學檢驗所和商業(yè)推廣機構。據(jù)悉，該公司近期將有進一步發(fā)展布局，十分值得期待。